1945 metais sausio 15 d. buvo atidaryta Kazlų Rūdos progimnazija
1946 metais įkurta Kazlų Rūdos gimnazija.
1949 metais išleista Pirmoji gimnazijos laida.
Nuo 1950 metų iki 1962 metų mokykla vadinama Kazlų Rūdos vidurine mokykla ir priklauso Kazlų Rūdos rajonui.
1954 m. balandžio 19 d. sudegė mokyklos pastatas.
1958 metais pastatyta nauja, dviejų aukštų vidurinė mokykla.
Nuo 1962 metų Kazlų Rūdos vidurinė mokykla priklauso Kapsuko rajonui.
Iki 1973 metų mokykla dirbo dviem pamainomis.
1973 metais spalio mėnesį atidarytas mokyklos priestatas.
1980 metais pastatytas naujas mokyklos bendrabutis.
1988 metais įvestas sustiprintas, diferencijuotas mokymas.
Nuo 1989 metų Kazlų Rūdos vidurinė mokykla priklauso Marijampolės rajonui.
1993 metais pradinukai persikėlė į darželio patalpas ir tapo savarankiška Kazlų Rūdos pradine mokykla.
1994 m. lapkričio 18 d. atidaryta pirmoji gimnazijos klasė.
1995 m. sausio 13 d. Lietuvos Respublikos Vyriausybės nutarimu Nr. 64 Kazlų Rūdos vidurinei mokyklai suteiktas Kazio Griniaus vardas.
1999 m. birželio 3 d. Kazlų Rūdos Kazio Griniaus vidurinei mokyklai suteiktas gimnazijos statusas. Nuo šiol mokykla vadinasi Kazlų Rūdos Kazio Griniaus gimnazija.
2003 m. liepos 1 d. Kazlų Rūdos Kazio Griniaus gimnazija reorganizuota į Kazlų Rūdos Kazio Griniaus išgrynintą keturmetę gimnaziją ir Kazlų Rūdos pagrindinę mokyklą.
2006 metais gimnazijoje lankėsi LR Prezidentas Valdas Adamkus.
2006 metais spalio mėn. vyko gimnazijos 60-mečio šventė.
2007 metais įgyvendintas gimnazijos vidaus renovacijos projektas.
2010 metais baigta pasato fasado renovacija.
2011 metais atnaujintas gimnazijos aikštynas.
2012 metais įvesta mokyklinė uniforma.
2016 metais išleista knyga iš gimnazijos istorijos „Po savo namų stogu“ I dalis.
2016 metais spalio mėn. vyko gimnazijos 70-mečio šventė.
2018 metais išleista 70-oji abiturientų laida.
2021 m. gegužės 31 d. Kazlų Rūdos savivaldybės tarybos sprendimu Kazlų Rūdos Kazio Griniaus gimnazija reorganizuota į ilgąją gimnaziją visų amžiaus tarpsnių vaikams.
Nuo 2021 m. rugsėjo 1 d. Kazlų Rūdos Kazio Griniaus gimnazija turi 7 skyrius: Prano Dovydaičio progimnazija, Kazlų Rūdos pradinė mokykla, lopšelis-darželis „Pušelė“, Antanavo mokykla, Bagotosios mokykla, Jankų mokykla, Ąžuolų Būdos darželis.
